Unidad de investigacion de efectos del medio, EFME

Dinámica Molecular Desarrollo de métodos QM/MM

Las Simulaciones Moleculares mediante la metodología QM/MM nos permiten explicar la capacidad catalítica de las enzimas en función de su estructura, lo que permite el descubrimiento de nuevas aplicaciones de moléculas conocidas, la predicción de efectos toxicológicos y el diseño de nuevas moléculas con propiedades químicas y farmacológicas deseadas.

La actividad investigadora del Grupo de I+D Unidad de investigación de efectos del medio, se centra en el en la descripción teórica de los procesos químicos en fases condensadas: soluciones y entornos biológicos. El grupo está dirigido por el Dr. Iñaki Tuñón y está adscrito al Departamento de Química Física de la Universitat de València.

Línea de investigación

• Simulación de procesos químicos en medios biológicos, Estudio por herramientas computacionales de reacciones químicas en las enzimas y solución acuosa por medio de QM / MM.

• Efectos dinámicos en la catálisis enzimática: racionalizar y cuantificar el acoplamiento dinámico entre la coordenada de reacción y el resto de grados de libertad del sistema en estudio.

• Análisis de las reacciones enzimáticas: las metiltransferasas: análisis de los mecanismo de reacción y los perfiles de energía.

• Análisis de las reacciones enzimáticas: la familia de fosfatasa alcalina: análisis teórico de la evolución de la familia fosfatasa alcalina.

Campos de aplicación

• Salud: principios activos para el tratamiento de diversas enfermedades.

• Materiales: nuevos semiconductores, superconductores, etc.

• Medioambiente: diseño de métodos de reacción más económicos y sostenibles, predicciones de ecotoxicidad, etc.

Servicios a empresas y otras entidades

Asesoramiento técnico y consultoría sobre:

• Diseño de nuevos compuestos mediante topología molecular.

• Diseño de métodos de reacción usando topología molecular.

• Predicción de ecotoxicidad

• Diseño de métodos de reacción más económicos y sostenibles

Otra información de interés

El Grupo de I+D Unidad de investigación de efectos del medio trabaja en el desarrollo metodológico y aplicaciones. Entre los más destacados aportes metodológicos se encuentra el programa GEPOL (un programa para calcular superficies y volúmenes moleculares y que se utiliza actualmente en muchas implementaciones de modelos continuos) y las contribuciones a la mejora de QM / MM descripciones híbridas de procesos enzimáticos. Las aplicaciones van desde la solubilidad de reactividad química y diseño racional asistido por ordenador de nuevos catalizadores biológicos e inhibidores.

Los resultados de su actividad investigadora han dado como resultado numerosos artículos científicos en revistas internacionales de alto impacto como Journal of Physical Chemistry, Biochemistry, Journal of Computational Chemistry, Current Opinion in Chemical Biology, Journal of the American Chemical Society, Nature Chemistry entre otras.

Área de conocimiento

• Química Física

• Bioquímica Física

• Enzimología

• Simulación Numérica

• Topología molecular