Grupo de Bioinformática y Computación Científica, GBCC

Bioinformática

Algoritmos para la secuencia de ADN

El desarrollo de nuevos algoritmos y aplicaciones matemáticas aplicados a la secuenciacion de ADN permite extraer parámetros fundamentales para llevar a cabo un diagnostico más preciso.

GBCC centra su investigación en el desarrollo de aplicaciones informáticas de altas prestaciones que optimizan el análisis de datos de la secuenciación de ADN. El objetivo principal del grupo es el desarrollo de nuevos algoritmos y aplicaciones para el procesamiento, análisis y visualización de datos bioinformáticos. GBCC es dirigido por el Dr. Vicente Arnau Llombart y se encuentra adscrito al Departamento de Informática de la Universitat de València.

Líneas de investigación

  • Bioinformática: Procesamiento, análisis e interpretación de la información biológica, mediante la integración de técnicas y herramientas de las matemáticas, la biología y la informática.
  • Paralelismo: Utilizamos programación paralela para el procesamiento de los datos bioinformáticos, que nos permite reducir considerablemente los tiempos de ejecución de los programas.

Campos de aplicación

  • Ciencias de la salud: Soluciones informáticas para la mejora de diagnósticos y que permitan el desarrollo de soluciones sanitarias más personalizadas, al mismo tiempo que mejoren la calidad y la eficiencia asistencial en el tratamiento y/o prevención diferentes patologías.

Servicios a empresas y otras entidades

Asesoramiento técnico y consultoría sobre

  • Desarrollo de soluciones de software avanzado con las que satisfacer las necesidades y problemáticas.
  • Desarrollo y aplicación de métodos teóricos y de análisis de datos, modelado matemático y técnicas de simulación computacional al estudio de sistemas de biológicos.
Formación

Formación especializada y a medida sobre:

  • Bases de Datos en Bioinformática.
  • Herramientas para el análisis de secuencias de ADN a escala genómica.
  • Análisis datos de Microarrays de DNA.

Productos

  • UVWORDWEB: Herramienta con 15 programas diferentes para análisis de secuencias de ADN a escala genómica (http://uvwordweb.uv.es/).
  • UVWORD: herramienta web para la aplicación de la técnica “oligonucleotide profiling” a secuencias de ADN (http://protegeno.uv.es/).
  • UVPAR: Herramienta para el análisis de secuencias proteicas codificadas por genes parálogos
  • UVDOM: Herramienta para filtrado de bases de datos de dominios proteicos.

Otra información de interés

GBCC ha participado en diversos proyectos de investigación, siendo los puntos comunes el desarrollo de aplicaciones informáticas que han demostrado sus ventajas en términos de eficiencia y exactitud en el análisis del ADN.

GBCC colabora con con entidades públicas impartiendo charlas y cursos de formación sobre la aplicación de la informática al análisis y visualización de datos bioinformáticos y a resolver los problemas que plantea la secuenciación del ADN.

El investigador principal del grupo colabora con el Departamento de Bioinformática y Genómica del Centro de Investigación Príncipe Felipe (CIPF, http://www.cipf.es/) y con el Laboratorio de Chips de ADN del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular de la UV.

 Área de conocimiento

  • Bioinformática
  • Arquitectura de ordenadores
  • Algoritmos y estructuras de datos
  • Minería de datos

Contacto

Grupo de Bioinformática y Computación Científica.Departamento de Informática. Universitat de València. (GBCC)

Vicente Arnau Llombart
Tel: +34 96 354 30 61
E-mail: vicente.arnau@uv.es
Homepage: https://www.uv.es/varnau